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生物医学大数据中心助力中国科学家在《Nature》发表重要科研成果——“揭秘新生造血干细胞在体归巢全过程”
作者:PICB    新闻时间:2018-11-21    已被阅读:219

日前,中国科学院上海营养与健康研究院潘巍峻研究员带领其研究团队,在国际上首次高清晰解析了体内造血干细胞归巢的完整动态过程。该研究成果于20181120日在线发表于国际知名学术期刊Nature(《自然》)。

造血干细胞归巢的概念由来已久,基于其归巢能力的造血干细胞移植已在临床被广泛应用于血液、免疫和肿瘤等重大疾病的治疗。但由于该生命过程的时空跨度非常大,观察手段十分有限。虽然科研人员在过去几十年的研究过程中,对归巢的细胞和分子基础进行了一定的解析,但归巢在体内动态情况下究竟如何发生,归巢的微环境究竟是何种结构,微环境细胞又是如何帮助造血干细胞归巢的等一系列关键科学原理依然知之甚少,严重制约了临床造血干细胞移植等相关技术的发展。

为攻克这一科技难题,潘巍峻研究员带领其团队历时6年,在优化活体成像技术的基础上,进一步整合活体免疫荧光标记、遗传调控和图形重构计算等方法,首创了一套全新的可以完整解析体内造血干细胞归巢全过程的研究体系。研究人员在国际上率先采用可变色荧光蛋白建立了造血干细胞标记系统,在高分辨率共聚焦荧光显微镜下,建立了造血干细胞长时程活体观察追踪方案,从宏观到微观,生动地呈现了造血干细胞从诞生到归巢的全过程。经过对大规模长时程活体成像的统计分析,发现了造血干细胞归巢的时空规律及“热点区域”,并结合精细成像和三维重构技术,首次揭示了体内造血干细胞归巢微环境的独特微血管结构。在研究过程中,他们还意外地发现了一种全新的微环境细胞,并将其命名为“先导细胞”。这类细胞是一种之前未被定义过的巨噬细胞新亚型,存在于归巢“热点区域”中,它们可以识别进入造血组织的造血干细胞并将其引入特定的血管结构中,从而实现造血干细胞的归巢。

这是由中国科学家独立完成的原创性科学发现,研究过程中突破了现有理论及研究体系,以独特的视角呈现了造血干细胞在生物体内归巢的全过程。开启了国际上造血干细胞领域的在体长时程、高分辨研究新时代。该工作不仅回答了“体内的造血干细胞归巢如何发生”这一世界造血干细胞研究领域的重大科学问题,而且发现了对于造血干细胞归巢起关键引导作用的“先导细胞”,为提高造血干细胞移植效率的转化研究提出了新理论,开创了新思路。

在本次研究工作中,大量的成像工作由中国科学院上海营养与健康研究院计算生物学研究所生物医学大数据中心下属“Uli Schwarz量化生物学平台”支撑完成,该平台负责人陈瑜洁在解决多样本长时程活体成像难题的过程中给予了研究人员很大的帮助,不但为LSM880激光共聚焦显微镜增加了多维实验编辑模块,还协助研究人员多次摸索和调试拍摄参数,最终帮助研究人员突破了该成像技术的瓶颈。

同时,该科研成果还在新一代组学数据汇交管理平台NODE*The National Omics Data Encyclopedia,国家组学数据百科全书)上公开发表了三维重构模型和活体成像视频数据,其中三维重构模型数据为NODE独家发布,展示了生物体内活体、内源造血干细胞归巢停留的“热点区域”。  该三维模型可以让读者自己旋转、切割,从而更好的理解这个结构的空间特征。以上数据可以通过以下链接进行访问和下载。

http://www.biosino.org/node/project/detail/OEP000169

                            

*NODE2016年正式上线,由中国科学院上海营养与健康研究院计算生物学研究所生物医学大数据中心开发并管理,截止至201811月,数据总量已突破138TB。其主要包括数据的发布、审阅、分享、管理、质量评估、下载与申请等,目前的访客达到52.6万人次,分布在23个国家和地区。