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 徐书华 研究员/马普青年科学家小组组长/博士生导师/所长助理

电子邮件  :xushuapicb.ac.cn
联系电话  :021-54920479
课题组主页:http://www.picb.ac.cn/PGG


    研究方向  

混合人群的遗传与微观进化


    研究领域  

徐书华博士长期致力于人类群体基因组学研究。专注于研究混合人群 (admixed population)的遗传和进化问题。发展和运用群体基因组学方法和计算生物学手段在混合人群的遗传结构、环境适应和微观进化机制研究方面取得了系统性的成果。
(1)人群混合的模型研究和混合动态过程的理论研究——通过理论推导、计算机仿真和实验数据分析研究了人群的混合模型和动力学机制,并为人类基因交流历史研究和复杂疾病基因定位研究提供理论指导;
(2)重组信息应用于人群混合历史及人口扩张时间估计——发展了利用遗传混合和重组信息研究人群历史的方法,从遗传学角度估计了亚太地区人群的基因交流和扩张时间;
(3)人群混合与环境适应——建立了检测混合人群自然选择的新策略,在全基因组水平揭示了美国黑人及我国藏族的环境适应以及亚洲人群的环境适应;
(4)人群混合对功能基因多样性的影响——系统研究了单基因疾病和复杂疾病基因的进化特征,探索了人群遗传混合对疾病相关基因和药物代谢基因多样性的影响及其机制; (5)探索人类复杂性状(包括疾病)发生发展的内在驱动力和演化机制。


    获奖情况  

•上海市优秀学术带头人(2016)
•获“国家杰出青年科学基金"(2015)
•国家自然科学奖(二等)(第2完成人)(2015)
•中国科学院“特聘研究员”-特聘核心骨干(2015)
•中国科学院青年创新促进会(首届)“优秀会员”(2015)
•浦东新区科技发展基金专家(2015)
•中国遗传学会第九届理事会中国遗传学会青年委员会委员(2013)
•2012-2013年度中国科学院青年创新促进会“优秀会员”(2013)
•国家“万人计划”第一批“青年拔尖人才”(2013)
•中科院青年科学家奖(2012)
•上海市第六届青年科技英才提名奖(2012)
•中科院上海生科院-美国礼来公司优秀毕业论文导师奖(2012)
•中科院上海分院第三届杰出青年科技人才奖(2012)
•教育部自然科学奖(一等)(第2完成人)(2012)
•首届中国科学院青年创新促进会(2011)
•全国百篇优秀博士学位论文(2011)
•上海市科技启明星(2011)
•复旦大学优秀博士学位论文(2010)
•上海市优秀博士学位论文(2009)
•法国赛诺菲-安万特-上海生科院青年人才奖(2009)
•日本明治乳业生命科学奖(2009)
•中国科学院卢嘉锡青年人才奖(2009)


    代表论文  

1. Haiyi Lou, Yan Lu, Dongsheng Lu, Ruiqing Fu, Xiaoji Wang, Qidi Feng, Sijie Wu, Yajun Yang, Shilin Li, Longli Kang, Yaqun Guan, Boon-Peng Hoh, Yeun-Jun Chung, Li Jin, Bing Su, Shuhua Xu*. A 3.4-kb Copy-Number Deletion near EPAS1 Is Significantly Enriched in High-Altitude Tibetans but Absent from the Denisovan Sequence. Am.J.Hum.Genet. 97(1):54-66. 2015.

2. Shuhua Xu*, Irina Pugach, Mark Stoneking, Manfred Kayser, Li Jin, The HUGO Pan-Asian SNP Consortium. Genetic Dating Indicates that the Asian-Papuan Admixture through Eastern Indonesia Corresponds to the Austronesian Expansion. PNAS 109(12):4574-4579. 2012.

3. Wenfei Jin, Sijia Wang, Haifeng Wang, Li Jin, Shuhua Xu*. Exploring Population Admixture Dynamics Using Empirical and Simulated Genome-Wide Distribution of Ancestral Chromosomal Segments. Am.J.Hum.Genet. 91:849-862. 2012.

4. Wenfei Jin, Pengfei Qin, Haiyi Lou, Li Jin*, Shuhua Xu*. A Systematic Characterization of Genes Underlying both Complex and Mendelian Diseases. Hum.Mol.Genet. 21(7):1611-1624. 2012.
 
5. Wenfei Jin, Shuhua Xu*, Haifeng Wang, Yongguo Li, Yiping Shen, Bailin Wu, Li Jin*. Genome-Wide Detection of Natural Selection in African Americans Pre-and Post-Admixture. Genome Research 22:519-527. 2012.
 
6. Shuhua Xu*, Shilin Li, Yajun Yang, Jingze Tan, Haiyi Lou, Wenfei Jin, Ling Yang, Xuedong Pan, Jiucun Wang, Yiping Shen, Bailin Wu, Hongyan Wang, Li Jin*. A Genome-Wide Search for Signals of High Altitude Adaptation in Tibetans. Mol.Biol.Evol. 28:1003-1011. 2011.
 
7. The HUGO Pan-Asian SNP Consortium (Li Jin*, Edison T. Liu*, Mark Seielstad*, Shuhua Xu*; 93 authors from 10 countries). Mapping Genetic Diversity in Asia. Science 326:1541-1545. 2009.

8. Shuhua Xu, Xianyong Yin, Shilin Li, Wenfei Jin, Haiyi Lou, Ling Yang, Xiaohong Gong, Xuejun Zhang, Xianyong Yin, Yungang He, Yajun Yang , Yi Wang, Wenqing Fu, Yu An, Jingze Tan, Jiucun Wang, Ji Qian, Xin Zhang, Yangfei Sun, Hongyan Wang ,Bailin Wu , Li Jin*. Genomic Dissection of Population Substructure of Han Chinese and Its Implication in Association Studies. Am.J.Hum.Genet. 85:762-774. 2009.

9. Shuhua Xu, Li Jin*. A Genome-wide Analysis of Admixture in Uyghurs and a High-Density Admixture Map for Disease-Gene Discovery. Am.J.Hum.Genet. 83:322-336. 2008.

10. Shuhua Xu, Wei Huang, Ji Qian, Li Jin*. Analysis of Genomic Admixture in Uyghur and Its Implication in Mapping Strategy. Am.J.Hum.Genet. 82:883-894. 2008.


    教育经历 & 学术背景  

徐书华,现为中科院-马普学会计算生物学伙伴研究所研究员、研究组长、博士生导师、中科院“特聘研究员”、兼任上海科技大学特聘教授;1996年进入湖北大学学习,获学士、硕士学位;2006年毕业于复旦大学,获博士学位;同年入职中科院-马普学会计算生物学伙伴研究所,历任助理研究员、副研究员,2009年应聘担任研究组长(PI);2011年应聘担任德国马普学会与中科院共同支持的马普青年科学家小组组长。2013年入选国家“万人计划”第一批“青年拔尖人才”;2015年获国家杰出青年基金;2016年入选上海市优秀学术带头人;兼任上海市遗传学会常务理事、上海市人类学会理事、中国遗传学会青年委员会委员、《Molecular Genetics and Genomics》(德国)编委、《Human Genomics》(英国)编委、《Hereditas》(英国)编委、《Scientific Reports》(英国)编委、《BMC Genetics》(英国)编委(Section Editor);国家自然基金委重点支持项目、中科院先导专项(B类)项目负责人;致力于群体基因组学研究,专注于混合人群的遗传和微观进化问题;在Science,AJHG,PNAS等发表SCI论文60多篇;曾获全国百篇优秀博士论文、中科院青年科学家奖、国家自然科学奖等。