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 杨力 研究员 研究组长 博士生导师 所长助理

电子邮件  :liyangpicb.ac.cn
联系电话  :021-54920233
课题组主页:http://www.picb.ac.cn/rnomics


    研究方向  

真核转录组系统生物学
计算转录组学与生物信息
新型长非编码RNA系统发掘及功能探索


    研究领域  

杨力博士长期从事转录组学研究,主要利用计算生物学和实验生物学相结合的方法,对真核生物RNA的表达调控在全转录组水平进行系统检测和功能研究。在RNA选择性剪接及新型长非编码RNA(尤其是环形RNA)生成加工机制和RNA编辑修饰等领域取得了一系列重要突破。具体来讲:
1.围绕人源胚胎干细胞及其定向分化过程中的RNA选择性剪接、RNA水平的修饰调控及非编码RNA新分子和新功能作用等开展研究。
2.开创性地建立全新高效的转录组分析计算流程和体系(CIRCexplorer等),系统研究并揭示了多种特殊结构新型长非编码RNA的加工生成机制及其生物学功能,并且这些分析流程已完全公开免费共享于GitHub,得到了领域内广泛的关注和应用。
3.建立全新计算分析流程,解析转录组中蕴含的高密度A-to-I RNA编辑区间及其组织差异性编辑调控。
4.利用多组学大数据,系统揭示基因表达的调控网络和调控机制,阐明其功能作用,并揭示异常调控与重大疾病发生发展的关系。
5.在全转录组水平,解析RNA的复杂调控网络及其在重要生理活动和病理发生中的作用。


    获奖情况  

•科技部中青年科技创新领军人才(2015)
•中国科学院优秀导师奖(2015)
•中国科学院大学-BHPB导师科研奖(2015)
•明治生命科学奖(2014)
•中科院“百人计划”(2012)
•人力资源和社会保障部留学人员科技活动项目择优资助(2012)
•上海市“浦江人才计划”(2011)
•Connecticut Stem Cell Seed Award by Connecticut State Department of Public Health,USA(2010)


    代表论文  

1. Zhang Y*, Xue W*, Li X, Zhang J, Chen S, Zhang JL, Yang L# and Chen LL#. The Biogenesis of Nascent Circular RNAs. Cell Rep, 2016, 15: 611-624 

2. Dong R, Zhang XO, Zhang Y, Ma XK, Chen LL and Yang L. CircRNA-derived pseudogenes. Cell Res, 2016, doi:10.1038/cr.2016.42 

3. Zhong C*, Xie Z*, Yin Q*, Dong R, Yang S, Wu Y, Yang L and Li J. Parthenogenetic haploid embryonic stem cells efficiently support mouse generation by oocyte injection. Cell Res, 2016, 26: 131-134

4. Yang L. Splicing noncoding RNAs from the inside out. WIREs RNA, 2015, doi: 10.1002/wrna.1307 (Invited review)

5. Zhong C*, Yin Q*, Xie Z*, Bai M*, Dong R*, Tang W, Xing YH, Zhang H, Yang S, Chen LL, Bartolomei MS, Ferguson-Smith A, Li D, Yang L#, Wu Y# and Li J#. CRISPR-Cas9-Mediated Genetic Screening in Mice with Haploid Embryonic Stem Cells Carrying a Guide RNA Library. Cell Stem Cell, 2015, 17: 1-12 

6. Chen LL# and Yang L#. Gear up in circles. Mol Cell, 2015, 58:715-717 (Preview) 

7. Chen LL# and Yang L#. Regulation of circRNA biogenesis. RNA Biology, 2015, 12: 381-388 

8. Chen T*, Xiang JF*, Zhu S*, Chen S, Yin QF, Zhang XO, Zhang J, Feng H, Dong R, Li XJ, Yang L# and Chen LL#. 2015. ADAR1 is required for differentiation and neural induction by regulating microRNA processing in a catalytically independent manner. Cell Res, 2015, 25: 459-476 

9. Yang L# and Chen LL#. Microexons go big. Cell, 2014, 159: 1488-1489 (Invited preview) 

10. Zhang XO*, Wang HB*, Zhang Y, Lu X, Chen LL# and Yang L#. Complementary sequence-mediated exon circularization. Cell, 2014, 159: 134-147 (Issue Highlight) 

11. Zhang XO*, Yin QF*, Wang HB, Zhang Y, Chen T, Zheng P, Lu X, Chen LL# and Yang L#. Species-specific alternative splicing leads to unique expression of sno-lncRNAs. BMC Genomics, 2014, 15: 287 (Highly Accessed) 

12. Zhang Y*, Zhang XO*, Chen T, Xiang JF, Yin QF, Xing YH, Zhu S, Yang L# and Chen LL#. Circular intronic long noncoding RNAs. Mol Cell, 2013, 51: 792-806 (Issue Highlight) 

13. Zhu S*, Xiang JF*, Tian C, Chen LL# and Yang L#. Prediction of constitutive A-to-I editing sites from human transcriptomes in the absence of genomic sequences. BMC Genomics, 2013,14: 206 (Highly Accessed)

14. Yang L, Duff MO, Graveley BR, Carmichael GG and Chen LL. Genomewide characterization of non-polyadenylated RNAs. Genome Biol, 2011, 12: R16 (Editor’s Pick and Highly Accessed) 

15. Graveley BR*, Brooks AN*, Carlson JW*, Duff MO*, Landolin JM*, Yang L*, Artieri CG, van Baren MJ, Boley N, Booth BW, Brown JB, Cherbas L, Davis CA, Dobin A, Li R, Lin W, Malone JH, Mattiuzzo NR, Miller D, Sturgill D, Tuch BB, Zaleski C, Zhang D, Blanchette M, Dudoit S, Eads B, Green RE, Hammonds A, Jiang L, Kapranov P, Langton L, Perrimon N, Sandler JE, Wan KH, Willingham A, Zhang Y, Zou Y, Andrews J, Bickel PJ, Brenner SE, Brent MR, Cherbas P, Gingeras TR, Hoskins RA, Kaufman TC, Oliver B and Celniker SE. The developmental transcriptome of Drosophila melanogaster. Nature, 2011, 471: 473-479