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 张国庆 研究员 平台研究组长 生物医学大数据中心副主任

电子邮件  :gqzhangpicb.ac.cn
联系电话  :null
课题组主页:http://www.biosino.org/node


    研究方向  

(1) 生物医学大数据综合平台

(2)生命科学知识库

(3) 精准医学知识库


    研究领域  

围绕生物医学大数据,构建大数据的分布式存储、计算、云服务综合性平台,进行生物医学数据库和知识库的设计、研发与运维,致力于微生物组、精准医学、表型组等领域的组学数据、文献数据、临床数据等的集成与管理,以及基于大数据的人类基因及其变异知识库构建。


    获奖情况  


    代表论文  

1) Shuang Yang, Guoqing Zhang, Wan Liu, Zhen Wang, Jifeng Zhang, Dongshan Yang, Y. Eugene Chen, Hong Sun, Yixue Li, SysFinder: A customized platform for search, comparison and assisted design of appropriate animal models based on systematic similarity, Journal of Genetics and Genomics, Volume 44, Issue 5, 251-258.

2) 张国庆,宁康,职晓阳,刘婉,徐萍,周豪魁,胡黔楠,赵国屏.建设微生物组大数据中心 发挥长期科学影响[J].中国科学院院刊,2017,(3):280-289.

3) Guoqing Zhang*, Yunsheng Zhang, Yunchao Ling, Jia Jia, Web Resources for Pharmacogenomics, Genomics, Proteomics & Bioinformatics, Volume 13, Issue 1, February 2015, Pages 51–54

4) Jian Chen, Jia Sheng, Dijing Lv, Yang Zhong, Guoqing Zhang*, Peng Nan*, The optimization of running time for a maximum common substructure-based algorithm and its application in drug design, Computational Biology and Chemistry, Volume 48, February 2014, Pages 14-20.

5) Ying He, Menghuan Zhang, Yuanhu Ju, Daqing Lv, Zhonghao Yu, Han Sun, Weilan Yuan, Fei He, Jianshe Zhang, Hong Li , Jing Li, Yixue Li, Guoqing Zhang*, Lu Xie*. dbDEPC 2.0: updated database of differentially expressed proteins in human cancers. Nucl. Acids Res. (2012) 40 (D1): D964-D971.

6) Shen Niu, Zhen Wang, Dongya Ge, Guoqing Zhang*, Yixue Li*. Prediction of functional phosphorylation sites by incorporating evolutionary information. Protein Cell 2012, Jun 16, epub.

7) 陈健, 鞠元虎, 张国庆, 南蓬. 活性小分子功能筛选平台:M & Function数据平台的设计与实现. 复旦大学学报(医学版), 2012 Vol. 39 (06): 633-640.


    教育经历 & 学术背景  

教育经历
2003年9月至2006年7月,华中科技大学生命科学与技术学院,生物医学工程专业,工学博士
2000年9月至2003年6月,华中科技大学生命科学与技术学院,生物医学工程专业,工学硕士
1996年9月至2000年7月,华中师范大学生命科学学院,生物化学专业,理学学士

工作经历
2016年12月至今,中国科学院上海生命科学研究院马普计算生物学研究所,生物医学大数据中心副主任,PI,研究员
2007年5月至2010年6月,中国科学院上海生命科学研究院,博士后
2007年9月-2016年12月,上海生物信息技术研究中心,生命科学数据中心部门主管
2006年7月-2007年9月,上海生物信息技术研究中心,生命科学数据中心技术骨干